Netriini-1 fokuksessa

Tänään tulin systemaattisessa TRIM-proteiinien luvuissani kohtaan Kromosomi14, TRIM9.
TRIM9 osallistuu  netriini-1-reseptorin ubikitinoimiseen ja täten myös reseporifunktioon. Ubikitinoidut DCC- reseptorit multimerisoituvat, jos netriini-1 signaali tulee reseptoriinsa DCC.
tässä vaikuttaa olevan hypoteeseja eikä aivan varmoja  yksityiskohtia. 

Kysymys MIKÄ ON NETRIINI-1?

 Pubmed haku.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_004813.2

Sen geeni on NTN1L  (17p13.1)   ja arvellaan että netriini-1 on anti-inflammatorinen   proteiini.  Esim. autoimmuunisessa enkefalomyeliitissä ja relapsoivassa remittoivassa MS_taudissa  netriini-1 pitoisuudet laskevat ja korreloivat nousseeseen TNFalfa pitoisuuteen.
Geeniä ilmenee eniten sydämessä, myös ruokatorvessa ja yhdessä muussa kudoksessa jonkin verran.

smart00136
Location:46 → 283

LamNT; Laminin N-terminal domain (domain VI)

cd00055
Location:284 → 329

EGF_Lam; Laminin-type epidermal growth factor-like domain; laminins are the major noncollagenous components of basement membranes that mediate cell adhesion, growth migration, and differentiation; the laminin-type epidermal growth factor-like module occurs in ...

cd03579
Location:487 → 601

NTR_netrin-1_like; NTR domain, Netrin-1-like subfamily; The C-terminal NTR domain of netrins is also called domain C in the context of C. elegans netrin UNC-6. Netrins are secreted proteins that function as tropic cues in the direction of axon growth and cell migration ...

pfam00053
Location:404 → 441

Laminin_EGF; Laminin EGF domain

ORIGIN      
        1 mmravweala alaavaclvg avrggpglsm fagqaaqpdp csdenghprr cipdfvnaaf
       61 gkdvrvsstc grpparycvv sergeerlrs chlcnasdpk kahppafltd lnnphnltcw
      121 qsenylqfph nvtltlslgk kfevtyvslq fcsprpesma iyksmdygrt wvpfqfystq
      181 crkmynrphr apitkqneqe avctdshtdm rplsggliaf stldgrpsah dfdnspvlqd
      241 wvtatdirva fsrlhtfgde neddselard syfyavsdlq vggrckcngh aarcvrdrdd
      301 slvcdcrhnt agpecdrckp fhydrpwqra tareanecva cncnlharrc rfnmelykls
      361 grksggvcln crhntagrhc hyckegyyrd mgkpithrka ckacdchpvg aagktcnqtt
      421 gqcpckdgvt gitcnrcakg yqqsrspiap cikipvappt taassveepe dcdsyckask
      481 gklkinmkky ckkdyavqih ilkadkagdw wkftvniisv ykqgtsrirr gdqslwirsr
      541 diackcpkik plkkylllgn aedspdqsgi vadksslviq wrdtwarrlr kfqqrekkgk
      601 ckka

 Kliininen artikkeli:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28677863

(Tiivistelmästä suomennsota) netriini-1 on axoninkasvua johtava proteiini ja se alentaa seerumin proinflammatoristen välittäjäaineitten pitoisuuksia ja stabiloi  veriaivoestettä(BBB) rajoittaen immuunisolujen pääsyä keskushermoston puolelle.  Tässä artikkelissa tutkijat kertovat   kokeellisen autoimmuunisen  enkefaliittimallin (EAE)    ja multippelisklerroositaudin (MS)  näytteiden  tutkimustuloksista.  MS- potilailta saadut nätyteet olivat sekä taudin  aktiivisesta että rauhallsiestai vaiheesta.

• Abstract  BACKGROUND AND PURPOSE: Netrin-1, an axon guidance protein, reduces serum levels of pro-inflammatory mediators and stabilizes the blood-brain barrier limiting the entrance of immune cells into the central nervous system. The aim was to investigate its presence in the experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE) model and in multiple sclerosis (MS) patients with and without clinical activity. Referenssisytokiini TNFalfa ja netriini-1  mitattiin ELISA- menetelmällä.

1. METHODS: Netrin-1 levels were evaluated in EAE mouse tissues. Afterwards, serum netrin-1 was cross-sectionally quantified in 90 patients with different MS phenotypes and 30 control subjects. An additional group of 10 relapsing-remitting MS (RRMS) patients was longitudinally evaluated throughout a relapse (RRMSr) with an interval of 60 days. Tumour necrosis factor α (TNFα), a reference inflammatory cytokine, and netrin-1 were quantified by enzyme-linked immunosorbent assay.

 EAE-hiirillä  oli merkitsevästi  matalemmat netriini1 ja korkeammat TNFalfa seerumi- ja likvoripitoisuudet  terveisiin kontrollihiiriin verrattuna. MS-potilaiden netriini-1 pitoisuus oli  merkitsevästi alempi kuin kotnrolleilla. Matalimmat netriini-1 proteiinipitoisuudet  havaittiin RRMS- taudissa ( MS tauti jossa on realpseja ja remissioita) ja  relapsin aikana netriini-1 pitoisuudet pysyttelivät  merkitsevästi matalampina.   TNFalfan seerumipitoisuudet olivat MS- potilailla korkeammat kontrolleihin verrattuna ja koreloivat negatiivisesti netriini-1 tasoihin.

• RESULTS: Experimental autoimmune encephalomyelitis mice showed significantly lower netrin-1 levels and higher TNFα amounts in sera, spinal cord and cerebella than healthy control mice. MS patients showed significantly lower serum netrin-1 levels than controls (511.62 ± 209.30 and 748.32 ± 103.24 pg/ml, respectively; P ≤ 0.005). The lowest protein levels were found in RRMSr, remaining significantly lower throughout the relapse. TNFα serum concentrations were higher in MS patients compared to controls, and negatively correlated with netrin-1 levels (r = -0.3734, P ≤ 0.0001).

Johtopäätös:  Netriini-1 on madaltunut autoimmuunisessa enkefalomyeliitissä ja MS- taudissa, lähinä relapsin aikana, mikä viitatisi netriini-1:n oelvan anti-inflammatorinen. netriinin merkitystä  biomerkitsijänä pitäisi arvioidaa laajemmassa  kohrottitutkimuksessa

• CONCLUSIONS: Netrin-1 decreased in EAE and in MS patients, mainly during relapse, suggesting an anti-inflammatory role of netrin-1. Further research should be performed in a larger cohort of patients to validate netrin-1 as a biomarker of MS inflammatory activity.

• KEYWORDS: biomarkers; experimental autoimmune encephalomyelitis; multiple sclerosis; netrin-1