Löysin tämän geenin systemaattisesti käydessäni läpi sinkkisormiproteiinien ryhmiä ja ryhmä GRF- tyyppinen sinkkisormiproteiini ZGRF, jossa on 7 proteiinia jhosta yksikään ei ole tgranskriptiotekijä. Ensimmäin on aika kookas eikä sille ole varsinanista omaa funktiota. tiedossa. SAen proteiinirakenteessa löytää grf- motiivia ainakin 16 sekvenssiå ja erittäin paljon p ja q rakenteita jopa 6 tai 7 p ja q peräkkäin joissain kohdin, sellaisia pätkiä jotka muistuttavat vehnän prolamiinia. Tuli mieleen että se on jokin hybridimuotoinen ja sen hajoittamisessa voi olla ongelmaa jos on esim keliakialle tyypillinen geenistö. Voisiko se olla sellainen geni, joka meioosissa vain isonee sukupolvesta toiseen.
Sen esiintymä on liitetty multigeenijoukkoon, josta aiheutuu lapsuuden puhehäiriöitä ja apraxiaa. Sopisi katsoa tämän liittymä keliakiageeneihin ja alttiuteen, sillä siinä tapauksessa että on keliakiageenistöä, pitäisi alkaa gluteeniton ravinto jo varhain ettei tämä aiheuta aivoperäistä taantumaa, jotain sakan kertymää jossain. Tämän proteiinin normaali degradaatiotiekään ei kai ole paremmin esillä. Otan protei9inin vielä tässä esiin, vaikka se on pitkä:
- Genetic Candidate Variants in Two Multigenerational Families with Childhood Apraxia of Speech. Peter B, et al. PLoS One, 2016. PMID 27120335, Free PMC Article
- A Comprehensive Analysis of Common and Rare Variants to Identify Adiposity Loci in Hispanic Americans: The IRAS Family Study (IRASFS). Gao C, et al. PLoS One, 2015. PMID 26599207, Free PMC Article
- A genome-wide association study on thyroid function and anti-thyroid peroxidase antibodies in Koreans. Kwak SH, et al. Hum Mol Genet, 2014 Aug 15. PMID 24722205, Free PMC Article
- The full-ORF clone resource of the German cDNA Consortium. Bechtel S, et al. BMC Genomics, 2007 Oct 31. PMID 17974005, Free PMC Article
- A systematic gene-based screen of chr4q22-q32 identifies association of a novel susceptibility gene, DKK2, with the quantitative trait of alcohol dependence symptom counts. Kalsi G, et al. Hum Mol Genet, 2010 Jun 15. PMID 20332099, Free PMC Article
- Two novel loci IDH1 and ZGRF1 are associated with adiposity. [meta-analysis]
- Observational study of gene-disease association. (HuGE Navigator)
-
NM_001350397.1 → NP_001337326.1 protein ZGRF1 isoform 2
Status: REVIEWED
ORIGIN
1 mesqefivly thqkmkkskv wqdgilkith lgnkailydd kgacleslfl kclevkpgdd
61 lesdrylitv eevkvagaig ivkqnvnkea pelnsrtfis sgrslgcqps glkrkftgfq
121 gprqvpkkmv imesgesaas heakktgpti fspfcsmppl fptvgkkdvn niladpeniv
181 tyknrernam dfssvfspsf qinpevlcee nyfcspvnsg nklsdslltn epvkrdslas
241 hysgvsqnir skaqilallk sessssceel nsemtehfpq kqpqgslkia tkpkyliqqe
301 ecaemksten lyyqhqsent mrnksrwamy lssqsspihs stvdgndter kpkaqeddvn
361 snlkdlslqk iiqfvetyae erkkynvdqs vgnndpswnq evkleipsfn essslqvtcs
421 saendgilse sdiqednkip fnqndkgcik gsvlikenaq evntcgtlek eyeqsesslp
481 elkhlqiess nnsrisddit dmiseskmdn eslnsihesl snvtqpflev tfnlnnfets
541 dteeesqesn kisqdseswv kdilvndgns cfqkrsentn ceeiegehlp fltsvsdkpt
601 vtfpvketlp sqfcdktyvg fdmgickten tgkeieeysd tlsnfesfkw tdavygdnke
661 dankpiqevr inydfalppn kskginmnlh iphiqnqiae nsnlfsedaq pqpfilgsdl
721 dkndehvlps tsssdnsvql lntnqnhyec ialdksnthi snslfyplgk khliskdtea
781 hisepedlgk irspppdhve vetaregkqy wnprnssels glvntisilk slcehstald
841 sleilkkknt vfqqgtqqty epdsppevrk pfitvvspks phlhkdsqqi lkedevelse
901 plqsvqfsss gskeetafqa vipkqierkt cdpkvtspee nistlspvst fslnsrdedf
961 mvefsetslk artlpddlhf lnlegmkksr slenenlqrl sllsrtqvpl itlprtdgpp
1021 dldshsymin sntyessgsp mlnlceksav lsfsiepedq netffseesr evnpgdvsln
1081 nistqskwlk yqntsqcnva tpnrvdkrit dgffaeavsg mhfrdtserq sdavnessld
1141 svhlqmikgm lyqqrqdfss qdsvsrkkvl slnlkqtskt eeiknvlggs tcynysvkdl
1201 qeisgselcf psgqkiksay lpqrqihipa vfqspahykq tftscliehl nillfglaqn
1261 lqkalskvdi sfytslkgek lknaennvps chhsqpaklv mvkkegpnkg rlfytcdgpk
1321 adrckffkwl edvtpgystq egarpgmvls diksiglylr sqkiplyeec qllvrkgfdf
1381 qrkqygklkk fttvnpefyn epktklylkl srkerssays kndlwvvskt ldfeldtfia
1441 csaffgpssi neieilplkg yfpsnwptnm vvhallvcna stelttlkni qdyfnpatlp
1501 ltqyllttss ptivsnkrvs krkfippaft nvstkfells lgatlklase liqvhklnkd
1561 qataliqiaq mmashesiee vkelqthtfp itiihgvfga gksyllavvi lffvqlfeks
1621 eaptignarp wkllissstn vavdrvllgl lslgfenfir vgsvrkiakp ilpyslhags
1681 eneseqlkel halmkedltp tervyvrksi eqhklgtnrt llkqvrvvgv tcaacpfpcm
1741 ndlkfpvvvl decsqitepa sllpiarfec eklilvgdpk qlpptiqgsd aahengleqt
1801 lfdrlclmgh kpillrtqyr chpaisaian dlfykgalmn gvteierspl lewlptlcfy
1861 nvkgleqier dnsfhnvaea tftlkliqsl iasgiagsmi gvitlyksqm yklchllsav
1921 dfhhpdiktv qvstvdafqg aekeiiilsc vrtrqvgfid sekrmnvalt rgkrhllivg
1981 nlaclrknql wgrviqhceg redglqhanq yepqlnhllk dyfekqveek qkkksekeks
2041 kdkshs
//
Katson isomeerin 1 q ja p esiintymät.
Paljon on leusiinia, lysiiniä ja seriiniäkin. On G-R-F sekvenssit
isolla kirjaimella
ORIGIN 1 mesqefivly thqkmkkskv wqdGilkith lgnkailydd kgacleslfl kclevkpgdd 61 lesdRylitv eevkvagaig ivkqnvnkea pelnsrtFis sGRslgcqps glkrkfFtGfq 121 gpRqvpkkmv imesgesaas heakktgpti Fspfcsmppl fptvGkkdvn niladpeniv 181 tyknRernam dFssvfspsf qinpevlcee nyfcspvnsG nklsdslltn epvkRdslas 241 hysgvsqnir skaqilallk sessssceel nsemtehFpq kqpqGslkia tkpkyliqqe 301 ecaemksten lyyqhqsent mRnksrwamy lssqsspihs stvdgndter kpkaqeddvn 361 snlkdlslqk iiqFvetyae erkkynvdqs vGnndpswnq evkleipsfn essslqvtcs 421 saendgilse sdiqednkip fnqndkgcik gsvlikenaq evntcgtlek eyeqsesslp 481 elkhlqiess nnsRisddit dmiseskmdn eslnsihesl snvtqpFlev tfnlnnfets 541 dteeesqesn kisqdseswv kdilvndGns cfqkRsentn ceeiegehlp Fltsvsdkpt 601 vtfpvketlp sqfcdktyvG fdmgickten tgkeieeysd tlsnfesfkw tdavygdnke 661 dankpiqevR inydFalppn kskGinmnlh iphiqnqiae nsnlfsedaq pqpfilgsdl 721 dkndehvlps tsssdnsvql lntnqnhyec ialdksnthi snslfyplgk khliskdtea 781 hisepedlgk irspppdhve vetaRegkqy wnprnssels glvntisilk slcehstald 841 sleilkkknt vFqqGtqqty epdsppevRk pFitvvspks phlhkdsqqi lkedevelse 901 plqsvqfsss Gskeetafqa vipkqieRkt cdpkpveFqG hqvkgsatsg vmvRghssql 961 gcsqFpdste yenfmtetpe lpstcmqidf lqvtspeeni stlspvstfs lnsrdedfmv 1021 efsetslkar tlpddlhfln leGmkksRsl enenlqrlsl lsrtqvplit lprtdgppdl 1081 dshsyminsn tyessgspml nlceksavls Fsiepedqne tffseesrev npGdvslnni 1141 stqskwlkyq ntsqcnvatp nRvdkritdg FfaeavsGmh fRdtserqsd avnessldsv 1201 hlqmikgmly qqrqdFssqd svsrkkvlsl nlkqtsktee iknvlGgstc ynysvkdlqe 1261 isgselcfps gqkiksaylp qRqihipavf qspahykqtF tscliehlni llfGlaqnlq 1321 kalskvdisf ytslkgeklk naennvpsch hsqpaklvmv kkegpnkgRl FytcdGpkad 1381 RckFfkwled vtpGystqeg aRpgmvlsdi ksiglylrsq kiplyeecql lvrkgFdfqr 1441 kqyGklkkft tvnpefynep ktklylklsR kerssayskn dlwvvsktld Feldtfiacs 1501 affGpssine ieilplkgyf psnwptnmvv hallvcnast elttlkniqd yfnpatlplt 1561 qyllttsspt ivsnkRvskr kFippaftnv stkfellslG atlklaseli qvhklnkdqa 1621 taliqiaqmm ashesieevk elqthtfpit iihgvfgagk syllavvilf fvqlfeksea 1681 ptignaRpwk llissstnva vdrvllglls lgFenfirvG svRkiakpil pyslhagsen 1741 eseqlkelha lmkedltpte rvyvrksieq hklgtnrtll kqvrvvgvtc aacpFpcmnd 1801 lkfpvvvlde csqitepasl lpiarfecek lilvGdpkql pptiqgsdaa hengleqtlf 1861 dRlclmghkp illrtqyrch paisaiandl FykgalmnGv teieRsplle wlptlcFynv 1921 kGleqieRdn sFhnvaeatf tlkliqslia sGiagsmigv itlyksqmyk lchllsavdf 1981 hhpdiktvqv stvdafqgae keiiilscvR trqvgFidse krmnvaltrG kRhllivgnl 2041 aclrknqlwg rviqhcegre dglqhanqye pqlnhllkdy fekqveekqk kksekekskd 2101 kshs //
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar