TRIM11, kr.1q42.13.

TRIM11, kromosomi 1q42.13

http://www.uniprot.org/uniprot/Q96F44

(Ensimmäisestä kromosomista löytyvä TRIM on TRIM11 ( Muitakin on 1. kromosomissa kuten TRIM17,-33,-45,-58,-62,-63 -ja 67. Katson nyt näitä 1 kromosomin TRIMEJÄ)

)

Siis TRIM11. Sen entsyymikoodi on EC.2.3.2.27. Sen muita nimiä ovat RNF92 eli se on RING finger proteiini 92. Lisäksi sillä on nimi: proteiini B1A1.

Se edistää liukenemattomien ubikitinoitujen proteiinien hajoittamista ja näihin proteiineihin kuuluu PAX6, polyglutamiinitoistolla laajentunut HTT ja polyalaniinitoistolla laajentunut ARX. TRIM11 välittää PAX6-ubikitinaatiota johtaen sitä proteosomisilppuriin, ja tällä se pystyy moduloimaan kortikaalista neurogeneesiä.

• (Etsin tätä PAX6 tekijää. Esim. silmässä PAX6 (Paired Box 6) tekee sukkulointia solutuman ja sytoplasman välillä Smad3 -signalointitiessä ja on tärkeä silmän morfogeneesissä ja funktionqaalisessa anatomiassa. PAX6 funktiot säätelee TGFbeta ja SPARC vaikuttaen sen sukkulointiin tuman ja sytoplasman välillä- (Nucleocytoplasmic shuttling). (SPARC= Secrfeted protein acidic and rich in cysteine)- Oletettu sykli on kuvattu alalolevassa linkissä. Siitä huomaa että PAX6 voi irrota sytoplasmassa näistä mainituista tekijöistä( katkoviiva) jolloin se saattaa joutua TRIM11 vaikutukseen ja ubikitinoitua. Arvelen. Jos TRIM11 on tuman puolella, se voi havaita myös PAX6 irtonaisena, kun se on irtomassa SMAD3:asta ja siirtymässä SPARC kompleksissa ulos tumasta. PAX6 sinänsä on transkriptiotekijä.

Lisäksi TRIM11 säätelee humaiinin (HN) tai sitä sisältävien proteiinin solun sisäistä pitoisuutta proteosomisilppuritienkautta .

Välittää myös MED15 ubikitinaatiota ja jothaa hajoitukseen silppurissa.

TRIM11 saataa myös osaltaan osallistua luonnolliseen retroviruksia rajoitavaan immuniteettiin. Jos TRIM11 on yliexpressoitunut, se vähentää HIV-1 viruksen ja hiiren leukemiaviruksen infektiivisyyttä vaimentamalla virusgeenin ilmenemää. Antivirusaktiviteeti riippuu funktionaalisesta E3 ubikitiini-proteiiniligaasi-domaanista.

TRIM11 saattaa säädellä TRIM5 vaihtumista proteosomitien kautta ja siten se vastavaikuttaa TRIM5- välitteiseen retrovirusten aiheuttamien infetioiden restriktioon retroviruksen elinsyklin varhaisvaiheissa.

UniProtKB - Q96F44 (TRI11_HUMAN)

• E3 ubiquitin-protein ligase that promotes the degradation of insoluble ubiquitinated proteins, including insoluble PAX6, poly-Gln repeat expanded HTT and poly-Ala repeat expanded ARX.
• Mediates PAX6 ubiquitination leading to proteasomal degradation, thereby modulating cortical neurogenesis. May also inhibit PAX6 transcriptional activity, possibly in part by preventing the binding of PAX6 to its consensus sequences.
• May contribute to the regulation of the intracellular level of HN (humanin) or HN-containing proteins through the proteasomal degradation pathway.
• Mediates MED15 ubiquitination leading to proteasomal degradation.
• May contribute to the innate restriction of retroviruses. Upon overexpression, reduces HIV-1 and murine leukemia virus infectivity, by suppressing viral gene expression. Antiviral activity depends on a functional E3 ubiquitin-protein ligase domain.
• May regulate TRIM5 turnover via the proteasome pathway, thus counteracting the TRIM5-mediated cross-species restriction of retroviral infection at early stages of the retroviral life cycle.

Catalytic activity:

S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N₆-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine.

Pathwayⁱ: protein ubiquitination

This protein is involved in the pathway protein ubiquitination, which is part of Protein modification.
View all proteins of this organism that are known to be involved in the pathway protein ubiquitination and in Protein modification.

MIKÄ ON PAX6?
 https://munin.uit.no/bitstream/handle/10037/12153/thesis.pdf?sequence=4
https://openi.nlm.nih.gov/detailedresult.php?img=PMC3335779_mv-v18-951-f4&req=4

 




Haku PubMed
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29434302
Glioblastoma PAX6 on oncogeeni :
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27863244

Glioblastoma stem cells (GSCs) are implicated in tumor neovascularization, invasiveness, and therapeutic resistance. To illuminate mechanisms governing these hallmark features, we developed a de novo glioblastoma multiforme (GBM) model derived from immortalized human neural stem/progenitor cells (hNSCs) to enable precise system-level comparisons of pre-malignant and oncogene-induced malignant states of NSCs. Integrated transcriptomic and epigenomic analyses uncovered a PAX6/DLX5 transcriptional program driving WNT5A-mediated GSC differentiation into endothelial-like cells (GdECs). GdECs recruit existing endothelial cells to promote peritumoral satellite lesions, which serve as a niche supporting the growth of invasive glioma cells away from the primary tumor. Clinical data reveal higher WNT5A and GdECs expression in peritumoral and recurrent GBMs relative to matched intratumoral and primary GBMs, respectively, supporting WNT5A-mediated GSC differentiation and invasive growth in disease recurrence. Thus, the PAX6/DLX5-WNT5A axis governs the diffuse spread of glioma cells throughout the brain parenchyma, contributing to the lethality of GBM.